保護自身合法權益，關鍵是要在合同中詳細約定知識產權方面的權利義務。在簽訂涉及知識產權的合同時，應加入知識產權條款，明確產生的知識產權的權利歸屬，雙方的權利、義務，以及關于轉讓、放棄、使用、爭議處理等事項。目前，相關部門正在進一步完善國防知識產權爭議解決途徑。